食品加工固然是潔凈室行業的小部分，但卻是穩定增長的一部分。由于食品工廠的總開支正以6%的速度增長，潔凈室開支的增長速度比資本支出更快，今后幾年潔凈室的開支將以每年8%的速度增加。 
      亞洲將經歷比均勻水平高的發展。東亞已是最大的食品加工潔凈室市場，這其中有一部分要歸功于潔凈室的作用。中國正日益成為更大的食品加工出口商。更重要的是，在美國這個市場正與改變飲食習慣一起迅速地成長。但是大的發展還是在不發達的亞洲國家。     
      到2015年，預計印度的食品加工產業的規模將擴大三倍，其他亞洲國家也在擴大食品加工。與北美貿易協定（NAFTA）相比，今年亞洲和歐洲都將在食品加工潔凈室方面花費更多。歐洲的增長率適中，但是很多食品加工廠已經裝有潔凈室。

      幾種趨勢促使在各種食品加工中使用潔凈室。人們對飲食的越關注，就越加重視普通食品質量和增加新鮮食品消費。同時，另一個巨大變化是盡量避免使用添加劑和防腐劑。
      進行了某種處理而改變了其微生物正常補充的食品特別輕易受環境微生物腐蝕。例如，酸牛奶、乳酪和其他奶制品，果汁、加味牛奶和主菜。蘑菇的生長有時也在潔凈室里進行以防止條件性病原孢子生長過度。
果汁 
      無菌產品已經占領了單包裝（250毫升 ）果汁和飲料市場。這個市場正擴展到其它的產品生產線，包括牛奶飲料、酒、水以及西紅柿產品和一公升大包裝。

奶制品 
      瑞士的酸牛奶、無菌牛奶或奶酪的加工，以及瑞典的香腸包裝中經常用到無菌處理。
      一些大型設施要求100,000級（ISO8和9級）以上。在美國，Jerome乳酪公司在愛達荷州杰羅姆建造了一個3,600萬美元，面積140,000 平方英尺的乳酪和乳清產品廠。該廠有4個主要加熱和透風系統可輸送高達每分鐘130,000立方英尺的過濾效率為95％的空氣，每小時換氣15到20次。車間采用正壓，空氣從加工區向外流。
公共和貿易廚房 
      在需要預備很多食品的地方利用潔凈室技術是有好處的。在法國Amiens，Sulzer公司為中心廚房設計了潔凈室，那里天天要給在校學生、老年人及城市雇員預備12,000頓飯。Sulzer裝備了ISO
5級（100級）潔凈室，以及必要的加熱和冷藏設施。 
釀酒廠 
      釀酒廠發現，為了保護其生啤酒，在填充操縱中必須控制環境污染。采用潔凈室進行封閉式填裝作業，天花板上安裝HEPA過濾器，地板帶孔已經成為發展趨勢。 
      南美哥倫比亞污染控制公司是一家為食品、醫藥和產業區建造清潔環境的專業公司。該公司在設計中為啤酒、果汁和汽水無菌填裝工藝增加了ISO 5級（100級）和ISO 6級（1,000級）潔凈室。 
      傳統系統中隧道式巴氏消毒法對產品進行各種高溫處理，得到的產品在物理特性上發生變化。相比之下，對受控巴氏消毒法的無菌充裝采用較低熱處理，可在幾方面改進產品的質量。
      在啤酒方面，可改進感官特性，例如香味風格和新鮮度。還可進一步多數產品的穩定性，延長儲存期。而用于果汁，則避免了像管道巴式消毒法那樣受到長時間高溫處理，因而沒有造成營養損失。結果，香味、口味及顏色等感官性能都得到改善。
肉類加工 
      美國聯邦農業部一項研究表明，美國的即食肉制品差未幾有5％都感染了單核細胞增多性李氏菌一種可以使人致命的食品傳染病菌，可導致敗血癥、腦膜炎或腦膜腦炎——一種影響大腦和脊髓組織的疾病。對于孕婦來說，李氏菌屬可引起胚胎夭折和死產。
即食肉制品市場的擴大是增加對潔凈室技術需求的一個因素。瑞典是這一領域的先行者。 
面包房 
      面包房現在正逐漸接受潔凈室技術。日本有很多這種例子。受神戶市的Nada Ward合作機構委托，Chiyoda建筑公司設計了一座通用食品廠。這一工廠有3000m2的建筑面積，是神戶市Rokko島上一個8層高的建筑，它使用了清潔技術。這個工廠生產幾種面包、糖果、大豆豆腐、面條和幾種傳統的日本食品。 
      糖果產業采用了生物潔凈室技術。新的、越來越復雜的、包裝新奇的糖果產品增加了對受控環境的需求（溫度、濕度、細菌的水平，等等），以及生產過程的自動化，以便保證良好品質和耐久性。
      食品產業的潔凈室成本隨清潔要求而不同。幾乎沒有ISO 3級和4級（1和10級）裝置。ISO 5級（100級）潔凈室成本是ISO 6級（1,000級）潔凈室的兩倍。成本隨清潔要求的降低而大大減少。只有一小部分食品潔凈室利用了ISO 5級（100級）空間。真正經常使用ISO 5級標準的是在諸如填裝生產線那樣的小區域。因此，根據區域而進行的空間劃分對更高級影響很大。 
      每個雇員使用的消耗品和一次性用品的年支出用度為790美元到7,500美元，多少取決于潔凈級別。
      即使ISO 5級（100級）的空間很小，用在每個雇員和每平方英尺上的消耗品大量支出表明，20%以上的用度用于購買這些更干凈的設備。 
      很顯然，食品產業是潔凈室市場的重要組成部分，將來十年將有穩定的增長，其中亞洲增長最大。新加工技術，消費者需求和治理要求將是保證發展的因素。